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00028 #ifdef __GNUC__
00029 #pragma interface
00030 #endif
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00032 #ifndef _chemistry_molecule_molrender_h
00033 #define _chemistry_molecule_molrender_h
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00035 #include <util/render/object.h>
00036 #include <util/keyval/keyval.h>
00037 #include <chemistry/molecule/molecule.h>
00038 #include <chemistry/molecule/atominfo.h>
00039 #include <math/isosurf/surf.h>
00040
00041 namespace sc {
00042
00043 class RenderedMolecule: public RenderedObject {
00044 protected:
00045 Ref<RenderedObject> object_;
00046 Ref<Molecule> mol_;
00047 Ref<AtomInfo> atominfo_;
00048
00049 public:
00050 RenderedMolecule(const Ref<KeyVal>& keyval);
00051 ~RenderedMolecule();
00052
00053 Ref<Molecule> molecule() { return mol_; }
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00056 virtual void init() = 0;
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00058 void render(const Ref<Render>&);
00059 };
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00062 class RenderedStickMolecule: public RenderedMolecule {
00063 protected:
00064 int use_color_;
00065 public:
00066 RenderedStickMolecule(const Ref<KeyVal>& keyval);
00067 ~RenderedStickMolecule();
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00069 void init();
00070 };
00071
00072 class RenderedBallMolecule: public RenderedMolecule {
00073 protected:
00074 public:
00075 RenderedBallMolecule(const Ref<KeyVal>& keyval);
00076 ~RenderedBallMolecule();
00077
00078 void init();
00079 };
00080
00081 class MoleculeColorizer: public DescribedClass {
00082 protected:
00083 Ref<Molecule> mol_;
00084 public:
00085 MoleculeColorizer(const Ref<Molecule> &);
00086 MoleculeColorizer(const Ref<KeyVal>&);
00087 ~MoleculeColorizer();
00088
00089 virtual void colorize(const Ref<RenderedPolygons> &) = 0;
00090 };
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00092
00093 class AtomProximityColorizer: public MoleculeColorizer {
00094 protected:
00095 Ref<AtomInfo> atominfo_;
00096 public:
00097 AtomProximityColorizer(const Ref<Molecule>&, const Ref<AtomInfo> &);
00098 AtomProximityColorizer(const Ref<KeyVal> &);
00099 ~AtomProximityColorizer();
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00101 void colorize(const Ref<RenderedPolygons> &);
00102 };
00103
00104 class RenderedMolecularSurface: public RenderedMolecule {
00105 protected:
00106 Ref<TriangulatedImplicitSurface> surf_;
00107 Ref<MoleculeColorizer> colorizer_;
00108 public:
00109 RenderedMolecularSurface(const Ref<KeyVal>& keyval);
00110 ~RenderedMolecularSurface();
00111
00112 void init(int reinit_surf);
00113 void init();
00114 };
00115
00116 }
00117
00118 #endif
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