OmegaT 1.6.1 è in grado di riconoscere autonomamente i seguenti tipi di file:
Alcuni interventi manuali consentiranno, inoltre, di tradurre anche file Microsoft Office. Sarà sufficiente utilizzare OpenOffice.org per convertire i file Microsoft Office da e in file OpenDocuments. Per i documenti Microsoft Word, un altro sistema è quello di salvare i file in formato HTML direttamente da Microsoft Word.